El Parque Nacional del Manu está ubicado en el sureste de Perú, abarcando el departamento de Madre de Dios y Cusco. Se encuentra en una región donde se unen las estribaciones de los Andes y la cuenca amazónica, lo que le otorga una gran diversidad geográfica y biológica.
Su ubicación geográfica aproximada es:
- Latitud: Entre 11° y 13° Sur.
- Longitud: Entre 71° y 73° Oeste.